Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1B8

Phf1, PHD finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf1Q9Z1B8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phf1Q9Z1B8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms