Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z123

Sema4f, Semaphorin-4F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4fQ9Z123 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sema4fQ9Z123 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sema4fQ9Z123 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sema4fQ9Z123 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sema4fQ9Z123 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sema4fQ9Z123 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sema4fQ9Z123 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sema4fQ9Z123 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sema4fQ9Z123 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sema4fQ9Z123 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sema4fQ9Z123 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sema4fQ9Z123 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sema4fQ9Z123 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sema4fQ9Z123 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sema4fQ9Z123 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sema4fQ9Z123 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms