Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y1

Dctn3, Dynactin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn3Q9Z0Y1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Dctn3Q9Z0Y1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dctn3Q9Z0Y1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dctn3Q9Z0Y1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dctn3Q9Z0Y1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dctn3Q9Z0Y1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dctn3Q9Z0Y1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dctn3Q9Z0Y1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dctn3Q9Z0Y1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dctn3Q9Z0Y1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dctn3Q9Z0Y1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dctn3Q9Z0Y1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dctn3Q9Z0Y1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dctn3Q9Z0Y1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dctn3Q9Z0Y1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Dctn3Q9Z0Y1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dctn3Q9Z0Y1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dctn3Q9Z0Y1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dctn3Q9Z0Y1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dctn3Q9Z0Y1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dctn3Q9Z0Y1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dctn3Q9Z0Y1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dctn3Q9Z0Y1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dctn3Q9Z0Y1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dctn3Q9Z0Y1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dctn3Q9Z0Y1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dctn3Q9Z0Y1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dctn3Q9Z0Y1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dctn3Q9Z0Y1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dctn3Q9Z0Y1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dctn3Q9Z0Y1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dctn3Q9Z0Y1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dctn3Q9Z0Y1 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dctn3Q9Z0Y1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dctn3Q9Z0Y1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dctn3Q9Z0Y1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dctn3Q9Z0Y1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dctn3Q9Z0Y1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dctn3Q9Z0Y1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dctn3Q9Z0Y1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dctn3Q9Z0Y1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dctn3Q9Z0Y1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dctn3Q9Z0Y1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dctn3Q9Z0Y1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dctn3Q9Z0Y1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dctn3Q9Z0Y1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dctn3Q9Z0Y1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Dctn3Q9Z0Y1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dctn3Q9Z0Y1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dctn3Q9Z0Y1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dctn3Q9Z0Y1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dctn3Q9Z0Y1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dctn3Q9Z0Y1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dctn3Q9Z0Y1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dctn3Q9Z0Y1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dctn3Q9Z0Y1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Dctn3Q9Z0Y1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dctn3Q9Z0Y1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dctn3Q9Z0Y1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dctn3Q9Z0Y1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms