Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms