Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms