Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnip1Q9WUU8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnip1Q9WUU8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnip1Q9WUU8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnip1Q9WUU8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnip1Q9WUU8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnip1Q9WUU8 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnip1Q9WUU8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnip1Q9WUU8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnip1Q9WUU8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnip1Q9WUU8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnip1Q9WUU8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnip1Q9WUU8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnip1Q9WUU8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnip1Q9WUU8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnip1Q9WUU8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnip1Q9WUU8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnip1Q9WUU8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnip1Q9WUU8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnip1Q9WUU8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnip1Q9WUU8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnip1Q9WUU8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnip1Q9WUU8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnip1Q9WUU8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnip1Q9WUU8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnip1Q9WUU8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnip1Q9WUU8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnip1Q9WUU8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnip1Q9WUU8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnip1Q9WUU8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnip1Q9WUU8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnip1Q9WUU8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnip1Q9WUU8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms