Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms