Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms