Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms