Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf4Q9QZS2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms