Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM3

Clcf1, Cardiotrophin-like cytokine factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcf1Q9QZM3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Clcf1Q9QZM3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms