Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ubxn8Q9QZ49 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms