Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Six6Q9QZ28 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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