Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Rdh11Q9QYF1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Rdh11Q9QYF1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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Rdh11Q9QYF1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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Rdh11Q9QYF1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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Rdh11Q9QYF1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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Rdh11Q9QYF1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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Rdh11Q9QYF1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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Rdh11Q9QYF1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
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Rdh11Q9QYF1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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