Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tomm40Q9QYA2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tomm40Q9QYA2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tomm40Q9QYA2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tomm40Q9QYA2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tomm40Q9QYA2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tomm40Q9QYA2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tomm40Q9QYA2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tomm40Q9QYA2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tomm40Q9QYA2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tomm40Q9QYA2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tomm40Q9QYA2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms