Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp3Q9QY23 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms