Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms