Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUG3

Prnd, Prion-like protein doppel, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrndQ9QUG3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
PrndQ9QUG3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrndQ9QUG3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrndQ9QUG3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrndQ9QUG3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrndQ9QUG3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrndQ9QUG3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms