Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc2lQ9JME7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc2lQ9JME7 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc2lQ9JME7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc2lQ9JME7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc2lQ9JME7 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc2lQ9JME7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc2lQ9JME7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trappc2lQ9JME7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trappc2lQ9JME7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trappc2lQ9JME7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trappc2lQ9JME7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trappc2lQ9JME7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc2lQ9JME7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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