Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM99

Prg4, Proteoglycan 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg4Q9JM99 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prg4Q9JM99 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prg4Q9JM99 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prg4Q9JM99 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prg4Q9JM99 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prg4Q9JM99 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prg4Q9JM99 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prg4Q9JM99 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prg4Q9JM99 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prg4Q9JM99 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prg4Q9JM99 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prg4Q9JM99 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prg4Q9JM99 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prg4Q9JM99 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prg4Q9JM99 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prg4Q9JM99 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prg4Q9JM99 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prg4Q9JM99 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prg4Q9JM99 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prg4Q9JM99 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prg4Q9JM99 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prg4Q9JM99 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prg4Q9JM99 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prg4Q9JM99 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prg4Q9JM99 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Prg4Q9JM99 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Prg4Q9JM99 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prg4Q9JM99 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Prg4Q9JM99 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prg4Q9JM99 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prg4Q9JM99 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prg4Q9JM99 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prg4Q9JM99 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prg4Q9JM99 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prg4Q9JM99 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prg4Q9JM99 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prg4Q9JM99 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prg4Q9JM99 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prg4Q9JM99 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prg4Q9JM99 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prg4Q9JM99 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prg4Q9JM99 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prg4Q9JM99 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prg4Q9JM99 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prg4Q9JM99 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prg4Q9JM99 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prg4Q9JM99 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prg4Q9JM99 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prg4Q9JM99 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prg4Q9JM99 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prg4Q9JM99 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prg4Q9JM99 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prg4Q9JM99 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prg4Q9JM99 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prg4Q9JM99 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prg4Q9JM99 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prg4Q9JM99 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prg4Q9JM99 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prg4Q9JM99 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prg4Q9JM99 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prg4Q9JM99 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prg4Q9JM99 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prg4Q9JM99 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prg4Q9JM99 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prg4Q9JM99 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Prg4Q9JM99 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Prg4Q9JM99 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prg4Q9JM99 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prg4Q9JM99 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prg4Q9JM99 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prg4Q9JM99 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms