Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM62

Reep6, Receptor expression-enhancing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep6Q9JM62 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms