Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf19Q9JLL3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf19Q9JLL3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf19Q9JLL3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf19Q9JLL3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf19Q9JLL3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf19Q9JLL3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf19Q9JLL3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf19Q9JLL3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf19Q9JLL3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf19Q9JLL3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf19Q9JLL3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf19Q9JLL3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf19Q9JLL3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf19Q9JLL3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
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Tnfrsf19Q9JLL3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf19Q9JLL3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf19Q9JLL3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf19Q9JLL3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf19Q9JLL3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf19Q9JLL3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf19Q9JLL3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf19Q9JLL3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf19Q9JLL3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf19Q9JLL3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf19Q9JLL3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf19Q9JLL3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Tnfrsf19Q9JLL3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf19Q9JLL3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf19Q9JLL3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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Tnfrsf19Q9JLL3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf19Q9JLL3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf19Q9JLL3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms