Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pkd2l2Q9JLG4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pkd2l2Q9JLG4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pkd2l2Q9JLG4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pkd2l2Q9JLG4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pkd2l2Q9JLG4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pkd2l2Q9JLG4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pkd2l2Q9JLG4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Pkd2l2Q9JLG4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Pkd2l2Q9JLG4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkd2l2Q9JLG4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms