Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Upk3aQ9JKX8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms