Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms