Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Tuba8Q9JJZ2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Tuba8Q9JJZ2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tuba8Q9JJZ2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tuba8Q9JJZ2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tuba8Q9JJZ2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tuba8Q9JJZ2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tuba8Q9JJZ2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tuba8Q9JJZ2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
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Tuba8Q9JJZ2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tuba8Q9JJZ2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tuba8Q9JJZ2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tuba8Q9JJZ2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tuba8Q9JJZ2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tuba8Q9JJZ2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Tuba8Q9JJZ2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tuba8Q9JJZ2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tuba8Q9JJZ2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tuba8Q9JJZ2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tuba8Q9JJZ2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Tuba8Q9JJZ2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tuba8Q9JJZ2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tuba8Q9JJZ2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tuba8Q9JJZ2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tuba8Q9JJZ2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tuba8Q9JJZ2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tuba8Q9JJZ2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Tuba8Q9JJZ2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tuba8Q9JJZ2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tuba8Q9JJZ2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tuba8Q9JJZ2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tuba8Q9JJZ2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tuba8Q9JJZ2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tuba8Q9JJZ2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tuba8Q9JJZ2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tuba8Q9JJZ2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tuba8Q9JJZ2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tuba8Q9JJZ2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tuba8Q9JJZ2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tuba8Q9JJZ2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tuba8Q9JJZ2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tuba8Q9JJZ2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tuba8Q9JJZ2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tuba8Q9JJZ2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tuba8Q9JJZ2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tuba8Q9JJZ2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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