Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS8

Slc12a4, Solute carrier family 12 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a4Q9JIS8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms