Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHS4

Clpx, ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpX-like, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpxQ9JHS4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms