Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhox9Q9EQM5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhox9Q9EQM5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhox9Q9EQM5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhox9Q9EQM5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhox9Q9EQM5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhox9Q9EQM5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhox9Q9EQM5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhox9Q9EQM5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhox9Q9EQM5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhox9Q9EQM5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhox9Q9EQM5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhox9Q9EQM5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhox9Q9EQM5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhox9Q9EQM5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhox9Q9EQM5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhox9Q9EQM5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhox9Q9EQM5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhox9Q9EQM5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhox9Q9EQM5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhox9Q9EQM5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhox9Q9EQM5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhox9Q9EQM5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhox9Q9EQM5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhox9Q9EQM5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhox9Q9EQM5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhox9Q9EQM5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhox9Q9EQM5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhox9Q9EQM5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhox9Q9EQM5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhox9Q9EQM5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhox9Q9EQM5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhox9Q9EQM5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhox9Q9EQM5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhox9Q9EQM5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhox9Q9EQM5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhox9Q9EQM5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rhox9Q9EQM5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rhox9Q9EQM5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rhox9Q9EQM5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rhox9Q9EQM5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rhox9Q9EQM5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rhox9Q9EQM5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rhox9Q9EQM5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rhox9Q9EQM5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rhox9Q9EQM5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rhox9Q9EQM5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms