Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ44

Vmn1r41, Vomeronasal type-1 receptor 41, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r41Q9EQ44 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r41Q9EQ44 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r41Q9EQ44 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r41Q9EQ44 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r41Q9EQ44 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r41Q9EQ44 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r41Q9EQ44 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r41Q9EQ44 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r41Q9EQ44 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r41Q9EQ44 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r41Q9EQ44 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r41Q9EQ44 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r41Q9EQ44 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r41Q9EQ44 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r41Q9EQ44 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r41Q9EQ44 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r41Q9EQ44 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r41Q9EQ44 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r41Q9EQ44 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r41Q9EQ44 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r41Q9EQ44 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r41Q9EQ44 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r41Q9EQ44 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r41Q9EQ44 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r41Q9EQ44 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r41Q9EQ44 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r41Q9EQ44 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r41Q9EQ44 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r41Q9EQ44 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r41Q9EQ44 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r41Q9EQ44 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r41Q9EQ44 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r41Q9EQ44 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r41Q9EQ44 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r41Q9EQ44 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r41Q9EQ44 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r41Q9EQ44 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r41Q9EQ44 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r41Q9EQ44 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r41Q9EQ44 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r41Q9EQ44 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r41Q9EQ44 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r41Q9EQ44 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r41Q9EQ44 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r41Q9EQ44 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r41Q9EQ44 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r41Q9EQ44 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r41Q9EQ44 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r41Q9EQ44 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r41Q9EQ44 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r41Q9EQ44 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r41Q9EQ44 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r41Q9EQ44 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r41Q9EQ44 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r41Q9EQ44 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r41Q9EQ44 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r41Q9EQ44 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r41Q9EQ44 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r41Q9EQ44 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r41Q9EQ44 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r41Q9EQ44 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r41Q9EQ44 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r41Q9EQ44 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r41Q9EQ44 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r41Q9EQ44 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r41Q9EQ44 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r41Q9EQ44 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r41Q9EQ44 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r41Q9EQ44 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r41Q9EQ44 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r41Q9EQ44 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r41Q9EQ44 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r41Q9EQ44 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r41Q9EQ44 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r41Q9EQ44 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r41Q9EQ44 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r41Q9EQ44 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r41Q9EQ44 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r41Q9EQ44 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r41Q9EQ44 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r41Q9EQ44 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r41Q9EQ44 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r41Q9EQ44 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r41Q9EQ44 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r41Q9EQ44 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r41Q9EQ44 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r41Q9EQ44 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r41Q9EQ44 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r41Q9EQ44 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r41Q9EQ44 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r41Q9EQ44 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r41Q9EQ44 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r41Q9EQ44 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r41Q9EQ44 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r41Q9EQ44 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r41Q9EQ44 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r41Q9EQ44 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r41Q9EQ44 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r41Q9EQ44 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r41Q9EQ44 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms