Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Tlr1Q9EPQ1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tlr1Q9EPQ1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tlr1Q9EPQ1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tlr1Q9EPQ1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tlr1Q9EPQ1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tlr1Q9EPQ1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Tlr1Q9EPQ1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tlr1Q9EPQ1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Tlr1Q9EPQ1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tlr1Q9EPQ1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tlr1Q9EPQ1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tlr1Q9EPQ1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tlr1Q9EPQ1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tlr1Q9EPQ1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tlr1Q9EPQ1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Tlr1Q9EPQ1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tlr1Q9EPQ1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Tlr1Q9EPQ1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tlr1Q9EPQ1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tlr1Q9EPQ1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tlr1Q9EPQ1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tlr1Q9EPQ1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tlr1Q9EPQ1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tlr1Q9EPQ1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tlr1Q9EPQ1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlr1Q9EPQ1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlr1Q9EPQ1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlr1Q9EPQ1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlr1Q9EPQ1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlr1Q9EPQ1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Tlr1Q9EPQ1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Tlr1Q9EPQ1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Tlr1Q9EPQ1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Tlr1Q9EPQ1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlr1Q9EPQ1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlr1Q9EPQ1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Tlr1Q9EPQ1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Tlr1Q9EPQ1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlr1Q9EPQ1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlr1Q9EPQ1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlr1Q9EPQ1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlr1Q9EPQ1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlr1Q9EPQ1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlr1Q9EPQ1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Tlr1Q9EPQ1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Tlr1Q9EPQ1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlr1Q9EPQ1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlr1Q9EPQ1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlr1Q9EPQ1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlr1Q9EPQ1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlr1Q9EPQ1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlr1Q9EPQ1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlr1Q9EPQ1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr1Q9EPQ1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr1Q9EPQ1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr1Q9EPQ1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr1Q9EPQ1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr1Q9EPQ1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr1Q9EPQ1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr1Q9EPQ1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr1Q9EPQ1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr1Q9EPQ1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr1Q9EPQ1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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Tlr1Q9EPQ1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr1Q9EPQ1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr1Q9EPQ1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr1Q9EPQ1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr1Q9EPQ1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms