Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT5

Sdf2, Stromal cell-derived factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdf2Q9DCT5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms