Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBI0

Tmprss6, Transmembrane protease serine 6, mousemouse

Predictions only

Length 811 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss6Q9DBI0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmprss6Q9DBI0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmprss6Q9DBI0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmprss6Q9DBI0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmprss6Q9DBI0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmprss6Q9DBI0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmprss6Q9DBI0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmprss6Q9DBI0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmprss6Q9DBI0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmprss6Q9DBI0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmprss6Q9DBI0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmprss6Q9DBI0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmprss6Q9DBI0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmprss6Q9DBI0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmprss6Q9DBI0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmprss6Q9DBI0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmprss6Q9DBI0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmprss6Q9DBI0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmprss6Q9DBI0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmprss6Q9DBI0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms