Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim23Q9DAL0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim23Q9DAL0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim23Q9DAL0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim23Q9DAL0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim23Q9DAL0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim23Q9DAL0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim23Q9DAL0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim23Q9DAL0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim23Q9DAL0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim23Q9DAL0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim23Q9DAL0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim23Q9DAL0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim23Q9DAL0 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim23Q9DAL0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim23Q9DAL0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim23Q9DAL0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim23Q9DAL0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim23Q9DAL0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim23Q9DAL0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim23Q9DAL0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim23Q9DAL0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim23Q9DAL0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim23Q9DAL0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim23Q9DAL0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim23Q9DAL0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim23Q9DAL0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim23Q9DAL0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim23Q9DAL0 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim23Q9DAL0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim23Q9DAL0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim23Q9DAL0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim23Q9DAL0 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim23Q9DAL0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim23Q9DAL0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim23Q9DAL0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim23Q9DAL0 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim23Q9DAL0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim23Q9DAL0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim23Q9DAL0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim23Q9DAL0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim23Q9DAL0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim23Q9DAL0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smim23Q9DAL0 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smim23Q9DAL0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smim23Q9DAL0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smim23Q9DAL0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smim23Q9DAL0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim23Q9DAL0 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms