Protein–RNA interactions for Protein: Q9D883

U2af1, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1Q9D883 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms