Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms