Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf13Q9D777 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms