Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms