Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F4

Gabra4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra4Q9D6F4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabra4Q9D6F4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabra4Q9D6F4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms