Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PudpQ9D5U5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms