Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5E3

4930449I24Rik, RIKEN cDNA 4930449I24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930449I24RikQ9D5E3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930449I24RikQ9D5E3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms