Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms