Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D4W2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D4W2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D4W2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D4W2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D4W2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D4W2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D4W2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D4W2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D4W2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D4W2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D4W2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D4W2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D4W2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D4W2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D4W2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D4W2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D4W2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D4W2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D4W2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D4W2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D4W2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D4W2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D4W2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D4W2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D4W2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D4W2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D4W2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D4W2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D4W2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D4W2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D4W2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D4W2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D4W2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D4W2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D4W2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D4W2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D4W2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D4W2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D4W2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D4W2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D4W2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D4W2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D4W2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D4W2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D4W2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D4W2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D4W2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D4W2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D4W2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D4W2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D4W2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D4W2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D4W2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D4W2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D4W2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D4W2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9D4W2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9D4W2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9D4W2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9D4W2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9D4W2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D4W2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D4W2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D4W2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D4W2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D4W2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D4W2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms