Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3Z8

4933425L06Rik, RIKEN cDNA 4933425L06, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933425L06RikQ9D3Z8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4933425L06RikQ9D3Z8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
4933425L06RikQ9D3Z8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4933425L06RikQ9D3Z8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4933425L06RikQ9D3Z8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4933425L06RikQ9D3Z8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
4933425L06RikQ9D3Z8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
4933425L06RikQ9D3Z8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
4933425L06RikQ9D3Z8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4933425L06RikQ9D3Z8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4933425L06RikQ9D3Z8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
4933425L06RikQ9D3Z8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4933425L06RikQ9D3Z8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
4933425L06RikQ9D3Z8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4933425L06RikQ9D3Z8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4933425L06RikQ9D3Z8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4933425L06RikQ9D3Z8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms