Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt20Q9D312 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms