Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SarnpQ9D1J3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SarnpQ9D1J3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms