Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms