Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0P8

Ift27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift27Q9D0P8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Ift27Q9D0P8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Ift27Q9D0P8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Ift27Q9D0P8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Ift27Q9D0P8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Ift27Q9D0P8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Ift27Q9D0P8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Ift27Q9D0P8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ift27Q9D0P8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ift27Q9D0P8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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