Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ70

3110001I22Rik, MCG129801, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3110001I22RikQ9CZ70 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms