Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snf8Q9CZ28 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snf8Q9CZ28 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snf8Q9CZ28 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snf8Q9CZ28 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snf8Q9CZ28 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snf8Q9CZ28 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snf8Q9CZ28 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snf8Q9CZ28 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snf8Q9CZ28 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Snf8Q9CZ28 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms